La Región cuenta con un clima desértico templado, con escasas lluvias durante el año. En precordillera y Altiplano se observan precipitaciones entre los meses de Diciembre y Marzo, provocadas por el invierno Altiplánico. La media anual en sector costero y valles interiores es de 19ºC. En sector Precordillerano y Altiplano durante el día las temperaturas fluctúan entre los 4º y 15º C. Durante las noches descienden abruptamente entre los 0º y 15º C, dependiendo la estación.